阿里山地区横跨台湾森林垂直分布之热、暖、温三带，蕴藏丰富的森林资源，尤以桧木名闻中外，漫步林间随处可见。红桧、台湾扁柏、台湾杉、铁杉及华山松称为阿里山五木，柳杉为本区人工造林最成功的外来树种，沿森林铁路漫山遍谷林木郁成奇观胜景。每年三月中旬至四月中旬为本区之樱花季 -- 吉野樱、重瓣樱、山樱花点缀满山，缤纷旖旎。其它花卉如森氏杜鹃、石楠花、毛地黄等等也陆续开放。另有列入保护之台湾一叶兰自然保留区，亦值得欣赏。